《植物生理学报》 2008, 44(2): 229-234

植物类防御素基因的预测和序列分析

李鑫，侯和胜*

辽宁师范大学生命科学学院，辽宁大连116029

通信作者：侯和胜；E-mail: hesheng_hou@126.com；Tel: 0411-82490 802

摘　要：

文章用已知的 9 种植物防御素基因为对照，根据 DFCI 数据库中 28 种植物的相关数据，进行 BLAST 同源性比对， 在 24 种植物中预测出 115 种新的类植物防御素基因。对它们进行序列比对、信号肽预测和进化树分析的结果表明：他们 与已知的植物防御素有很高的同源性，且具备植物防御素的基本特征。

关键词：植物防御素；基因预测；序列分析

收稿：2007-11-27   修定：2008-02-27

资助：国家自然科学基金(30671439)。

植物类防御素基因的预测和序列分析

李鑫，侯和胜*

辽宁师范大学生命科学学院，辽宁大连116029

Corresponding author: ; E-mail: hesheng_hou@126.com; Tel: 0411-82490 802

Abstract:

文章用已知的 9 种植物防御素基因为对照，根据 DFCI 数据库中 28 种植物的相关数据，进行 BLAST 同源性比对， 在 24 种植物中预测出 115 种新的类植物防御素基因。对它们进行序列比对、信号肽预测和进化树分析的结果表明：他们 与已知的植物防御素有很高的同源性，且具备植物防御素的基本特征。

Key words: 植物防御素；基因预测；序列分析